Rozbieżności między stanem systemowym a rzeczywistym wynikają najczęściej z niezarejestrowanych operacji. Każde wydanie bez dokumentu, pomyłka przy przyjęciu czy uszkodzenie towaru nieodnotowane w systemie kumuluje się w czasie. Brak bieżącej weryfikacji sprawia, że błędy narastają przez miesiące. Dodatkowym czynnikiem bywają kradzieże lub pomyłki przy wprowadzaniu danych. System WMS minimalizuje te problemy poprzez wymuszanie rejestracji każdej operacji w czasie rzeczywistym.